Per quanto riguarda la posizione dell’ulcera, è nel sistema genito-urinario. Nei maschi, l’ulcera della sifilide appare sul pene soprattutto nella parte anteriore (glande del pene) o all’interno dell’uretra, seguita da una secrezione viscosa del dotto, o nella femmina, l’ulcera appare sulla vulva, l’uretra e la cervice. Nelle femmine, il primo stadio a volte non appare e la malattia viene diagnosticata nel secondo stadio. La sifilide è stata trovata su labbra, ano, dita, faringe, lingua e capezzoli nel 10 percento degli infetti.
Dopo circa una settimana di ulcere, i linfonodi si gonfiano e, poiché il sistema riproduttivo è infetto, le ghiandole linfatiche che si gonfiano sono i linfonodi inguinali nella zona pubica superiore sui lati e sulle cosce e di solito guariscono le ulcere entro 4 -8 settimane automaticamente o con la cura.